Le havre de l’Anse-à-Beaufils est un port de pêche très actif qui fait partie du réseau de Pêches et Océans Canada. Pendant une certaine période de l’année, au moins 25 à 30 pêcheurs de homard en font leur port d’attache. D’autres pêcheurs continuent pendant la saison estivale leurs opérations dans ce port. À noter que pendant toute cette saison s’ajoutent d’autres utilisateurs importants, soit les bateaux qui offrent des croisières à partir de Percé. Ils utilisent le port de l’Anse-à-Beaufils pour s’y abriter pendant la nuit et repartent le lendemain matin vers Percé.

Le havre possède des quais fixes et quelques quais flottants pour les pêcheurs commerciaux. L’abri y est très sécuritaire et le plus grand danger vient de l’intérieur, car ce port se situe dans l’estuaire de la rivière de l’Anse-à-Beaufils. Le niveau de cette rivière varie très rapidement lors de fortes pluies créant ainsi un fort débit. Des arbres déracinés et une grande quantité de sédiments peuvent être charriés lors de fortes précipitations. Un dragage d’entretien s’effectue annuellement vers le mois de juillet.

Le havre est maintenant le carrefour de nombreuses activités portuaires et culturelles. L’usine de transformation du poisson, qui a été le centre des activités de pêche du havre pendant nombre d’années, est maintenant le centre d’activités culturelles. S’ajoute à cette activité le magasin Robin, un centre d’interprétation privé. Sentiers et plages et bien sûr le rocher Percé comme  voisin.

Le havre est aménagé pour desservir en même temps sa clientèle professionnelle, les pêcheurs et les opérateurs de bateaux de croisière de Percé. Il possède aussi des infrastructures et des services pour accommoder la clientèle touristique, qui depuis plusieurs années, le fréquente assidûment.

Il n’y a pas de quai de service pour la vente des produits pétroliers et de vidange de réservoir septique. La profondeur dans le bassin varie de 1 à 3m. Le havre dispose d’environ 20 places pour des bateaux visiteurs, mais ils doivent quitter en cas de besoin des opérateurs de bateaux de croisière de Percé. De nouveaux pontons devraient ajouter 25 à 30 places pour l’été 2008. Ces places supplémentaires serviront aux pêcheurs, aux locaux et aux visiteurs.